微生物肥料和化肥之间是互补关系。两者应该根据农作物的需求和土壤的墒情，有所侧重，搭配使用，这样才能保证农作物的健康茁壮成长。用了微生物肥料可以提高化肥的利用率、可以少用化肥、克服了单用化肥会使土壤板结、漏水、漏肥等特点。