1、交易模式不同。深市采用的是集合竞价模式，沪市采用的是连续竞价模式。

2、过户费不同。深市不会收取用户的过户费，沪市过户需要按照每1000股收取用户1元的过户费。

3、股票代码不同。深市主板、中小板、创业板、B股的股票代码分别是以000、002、300、200开头的，沪市的主板股票代码都是以6开头的，B股是以900开头的。

4、申购基金数不同。申购深市股票资金账号最低为500股，并且以每500股为一个基数单位;申购沪市股票资金账号最低申购1000股，以每1000股为一个基数单位。