1、手续费：使用网银进行跨行转账交易时，额度高于5千往往都是需要支付一定的手续费用的；而使用手机银行跨行转账是没有手续费的。

2、运行载体：网银主要是通过电脑进行登录的，在没有电脑的时候是无法使用网上银行的；而手机银行的载体是手机端，手机是人们的生活必需品，可以随时随地使用。

3、网上银行和手机银行是可以同时开通的，也可以单独开通，用户可以根据自己的需求进行选择。