1、统筹发展和安全，增强忧患意识，做到居安思危，这是总体国家安全观的重要内容。要充分认识生物安全立法的必要性和紧迫性，通过立法确立维护生物安全的基础性制度，突出风险防范，保障人民生命健康，依法划定生物技术发展边界，保障和促进生物技术健康发展。

2、风险预防原则，它是绝大多数国家普遍采用的生物安全监管原则，是首要原则，是成本最低也是最为有效的管理原则。

3、科学证据原则，它是对风险预防原则的合理制衡，以防止风险预防原则的滥用。

4、分级管理原则，它是根据生物安全威胁程度不同而采取的区别管理对策。