经期同房会使女性发生自子宫内膜的异位现象，同时由于细菌可随男性生殖器进入阴道，从而产生细菌感染性的疾病，例如各类的妇科炎症疾病。另外，此时同房还可能导致女性之后的生育障碍，引发不孕不育。