农商银行自动扣款没有具体的时间，因为不同的地区的农商银行结算系统都是独立的，所有不同的农商银行扣款的时间也不一样。一般来说，办理了农商银行的房贷，或是持有农商银行的信用卡开通了农商银行自动还款功能，将会在到期还款日当天的24点前扣款成功。