吡噻菌胺不能和微生物农药混用。因为吡噻菌胺是新颖酰胺类杀菌剂，会对微生物有一定的杀伤效果，混用会引起药效减弱或者失效。吡噻菌胺主要用于防治防治锈病、灰霉病、菌核病、霜霉病、苹果黑星病和白粉病，注意不要超量使用。