1、投资起点不同：沪市10万起投，投资金额需要是10万的整数倍;深圳1000起投，投资金额只需是1000的整数倍即可。

2、名称不一样：沪市逆回购的品种名称以GC开头，深市逆回购的品种名称以R开头。两市逆回购名称都是后接数字代表期限，例如GC007，代表的就是沪市7日逆回购。

3、逆回购的收益高峰一般是在长假期间：因为此时市场对于流动性的需求要更高。2017年十一假期，沪深交易所1天期逆回购利率均超过了10%;到了元旦假期，1天期逆回购利率再度飙升，均超过20%。