1、保障人群。城乡居民医疗保险的保障对象是没有工作的居民，和没有参加城镇职工医疗保险的城镇未成年人；而新农合的保障对象主要就是农村农民。

2、保障力度。城乡居民医疗保险在大医院的报销比例比新农合高；而新农合在乡镇卫生院的报销费用就比较高。

3、缴费报销比例。城镇居民医疗保险的报销比例是85%，根据不同等级的医院，新农合的报销比例在10%-80%不等。