1、定义不同：oa管理系统是指办公自动化是将现代化办公和计算机技术结合起来的一种新型的办公方式。项目管理的流程是指每个阶段都有自己的起止范围，有本阶段的输入文件和本阶段要产生的输出文件。

2、目标不同：OA系统主要目标是企业日常运营服务，项目管理系统则侧重对项目的管理。

3、功能不同：OA主要用于管理企业内部审批流程、文档等信息，项目管理系统相对而言会更加严谨，可以做到精细化管理。最后它们的投入不同，如今OA管理系统已经过了教育期，推行起来比较快，易于操作，项目管理系统则需要进行相应的普及与培训才能使用。