将适量的食醋倒进牙缸中，使杯底的污渍完全浸泡在醋里，静置半个小时后，即可将聚集在杯底的污渍彻底的清除掉，之后再将牙刷杯放在清水中浸泡五分钟左右即可。牙缸至少一个星期要进行一次清洁，让它保持干燥，还可定期煮沸消毒。

牙缸里的黑渍多是人们在使用牙缸时未作好清洁工作引起，再加上牙缸一直存放于很潮湿的卫生间里。牙刷杯里如果有水，很容易滋生霉菌，时间长了形成黑垢。日常可用一些有刷毛的刷子清洗，但要经常性的清洗，水质不好很容易导致水垢产生，从而滋生细菌。