1、惠农卡是会查征信的，首先惠农卡贷款是从农业银行放款，在申请惠农卡贷款时银行会查询申请人个人资质。

2、如果申请人信用有问题，则贷款是不会通过，惠农卡贷款是属于银行贷款，国家规定银行贷款都是需要查询个人征信才能下款。

3、在申请惠农卡的时候需要农村户口，而惠农卡贷款只能选择一个人办理，在申请惠农卡贷款的时候是需要担保人的，一般在提交资料申请惠农卡贷款后，会审核申请人的资质、家庭情况、家庭收入和申请收入能力来决定是否下款，整个过程一般在三天左右，具体根据银行审核时间为准。