譬如，此前评估检查中的“末位淘汰”原则就一度引发争议。有政协委员就提出，末位淘汰虽然管理成本低，但却有简单粗暴之嫌，如一些冷门学科和经典学科，很难发表出引用率非常高的SCI论文,就会被排在末尾从而可能被摘牌，这不利于人才队伍建设和学科发展。此次作为新的发展意见下发后的第一次评估，被整改的实验室到底是像一些专家所建议的改“末位淘汰”为“差额支持”，还是被摘牌，仍待观察。

今年的政府工作报告新增了“抓紧布局国家实验室，重组国家重点实验室体系”等表述。上述意见也明确，实验室经优化调整和新建，数量稳中有增，总量保持在700个左右。这说明，更多的高校，将有可能创建国家重点实验室，但与此同时，从评估来看，国家重点实验室的“质量”把关依然未松懈，如何确保数量与质量的双重提升，是对具体高校及相关管理的考验。